Биоинформатики по новой методике сумели работать с сильно загрязнёнными древними образцами и сделали задел по анализу ядерного генома неандертальского ребёнка из грота Тешик-Таш. Ранее попытки секвенирования сталкивались с обилием ДНК современных людей в подготовленных библиотеках, что делало задачу почти невыполнимой. Теперь же группа за счёт разработки admixslug смогла оперировать на уровне данных, где качество чтения целевого генома остаётся очень низким. Эта технология позволила подтвердить, что останки принадлежат мальчику, а не лицу женского пола, как ранее предполагалось. Источник: блоки 2, 7.

Метод оказался испытан на образцах Mezmaiskaya-2 и затем применён к Тешик-Ташу. У Mezmaiskaya-2 возраст неандертальца оценивается примерно в 45 тысяч лет назад, что служит верификацией метода на примерах далёкого прошлого. Для исследования ребёнка из Тешик-Таша для построения генетического профиля использовали библиотеки, созданные в 2015 году из височной кости и в 2019 году — из длинной кости. Эти данные позволили перейти к анализу ядерного генома, который ранее был недоступен. Источник: блоки 7, 5, 6.

Полученная информация указывает, что останки действительно принадлежат мальчику, и дополнительно по словам авторов это подтверждается недавно выполненным палеопротеомным анализом зубной эмали, результаты которого планируются опубликовать отдельно. Что касается генетического положения индивида, его геномы оказались ближе к европейским неандертальцам, представленным поздней неандертальской популяцией из хорватской пещеры Виндия, хотя источники указывают, что общий предковый поток между популяциями разошёлся примерно 100–80 тысяч лет назад. Источник: блоки 8, 9.

Сравнение с денисовцами показывает, что денисовцев в геноме мальчика из Тешик-Таша не обнаружено. У анализируемого индивида не выявлено следов денисовской примеси, что подтверждает отсутствие прямого генетического вклада этих групп в этот конкретный образец. Эти детали дополняют картину генетического положения неандертальцев на территории Центральной Азии и соседних регионов. Источник: блок 9.

Контекст исследования подчёркивает, что в Европе поздние неандертальцы между 57 и 40 тысячами лет назад демонстрировали крайне низкое митохондриальное разнообразие, что возможно связано с бутылочным горлышком популяций во время ледниковых пиков. Это замечание помогает объяснить современное разнообразие и этногенез неандертальских групп, хотя прямых связей с конкретным образцом из Тешик-Таша не отмечается. Источник: блок 10.