Colossal Biosciences объявила об запуске новой AI-платформы GenoMorph, призванной ускорить работы по возвращению исчезнувших видов. Об этом изданию TechCrunch сообщили эксклюзивно представители компании. GenoMorph позиционируется как инструмент, который помогает идентифицировать генетические участки для редактирования в проектах деконсервации, опираясь на ограниченное количество данных по ДНК. В частности, платформа применяется в рамках стремления вернуть додо — у которого имеются всего несколько полноценных геномов.

По словам Colossal, гомологический анализ для додо осложнен тем, что доступно лишь одно полное геномное собрание по сравнению с примерно 100-genomes, получаемыми в рамках проектов по мамонту. Кроме того, ДНК мамонтов сохранилась лучше из-за холодного климата, в то время как додо обитал в тропиках, что влияет на сохранность генетического материала.

Глава Colossal Бен Лэм отметил: в обычных условиях учёные сравнивают многиеgenomes, чтобы определить, какие генетические различия отвечают за определённые признаки. Но с древними ДНК исчезнувших видов такой роскоши нет — доступно крайне ограниченное число полных геномов.

Для создания GenoMorph Лэм рассказал, что компания собрала данные развития у цыплят, перепёлок, уток и голубей, а также соединила их с генетической и трёхмерной информацией черепов более 70 видов птиц. По его словам, над платформой работали более года, опираясь на многолетний опыт Colossal в области деконсервации.

По описанию Лэма, ИИ распознаёт активность участков ДНК во время формирования клювов и лицевых структур у птиц и с помощью этой информации предсказывает те генетические выключатели, которые могли бы придать додо его характерный облик. У платформы, по словам руководителя, можно представить «сокровищницу» генома додо, помогающую сузить поиск значимых различий вместо того, чтобы разыскивать их в большом массиве потенциальных изменений.

На сегодняшний день GenoMorph якобы помог выявить около 2300 многообещающих целей редактирования ДНК для краниальной и лицевой морфологии додо, которые теперь можно тестировать в лаборатории. Лэм подчёркивал, что GenoMorph призван решить один из главных «узких мест» в попытках вернуть исчезнувших животных — определить, какие изменения действительно делают вид уникальным. Но учёные также должны проверить, действительно ли эти правки могут приводить к нужным физическим признакам осталось проверить.

Помимо этого Colossal заявил о разработке новой системы доставки генетических инструментов с помощью липидных наночастиц прямо в эмбрионы развивающихся птиц, что, по словам Лэма, позволит наблюдать влияние отдельных изменений без необходимости ожидать полного цикла размножения птиц до половой зрелости.

Также на пресс-конференции стало известно: Nicobar-перепелка сейчас состоит из 36 особей, а команда успешно создала необходимые клетки, превращающиеся в яйцеклетки и сперму — ключевой шаг в их стратегии переноса признаков додо на близкого родственника. По словам Лэма, ближайшим родственником додо считается Nicobar pigeon, и эти клетки критичны для попыток повести птиц с признаками додо. В дальнейшем компания планирует проверить предсказания GenoMorph в лабораторных условиях. Дополнительно он отметил, что достижения разных разработок начинают сходиться и могут поддержать другие проекты в «дереве жизни».