Научная команда Bat1K, объединяющая исследователей из 64 стран, пересматривает историю происхождения рукокрылых. По их реконструкциям, эти млекопитающие возникли и уже умели летать в позднем палеоцене на территории Европы — примерно 60 миллионов лет назад. Затем они расселились в Африку, а впоследствии неоднократно колонизировали Северную и Южную Америку, Азию и Австралию. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature и основаны на объединении геномных данных 103 видов, охватывающих 21 современное семейство и включающих как ныне живущие, так и ископаемые представления. Эти выводы подкрепляют ранее сформировавшееся представление о северо-атлантическом старте отряда и подчёркивают роль Европы как источника диверсификации рукокрылых.

Авторы работ реконструировали филогенетическое древо всего отряда и подтвердили деление рукокрылых на две крупные группы — инь-рукокрылых (Yinpterochiroptera) и ян-рукокрылых (Yangochiroptera). В первую группу входят крыланы и пять семейств летучих мышей, включая подковоносов и ложных вампиров; ко второй стороне относятся оставшиеся 15 семейств. В публикации подчёркнуто, что данные не поддерживают идею о перераспределении всех летучих мышей в одну и ту же подотрядную группу, как когда-то предполагалось.

Исследование также расширяет картину по структурам надсемейств и хромосомам: было показано, что мадагаскарские присосконоги пополнили надсемейство Vespertilionoidea как первая ветвь эволотического дерева, отделившаяся от общего ствола группы, а Emballonuroidea оказалась сестринской по отношению к Vespertilionoidea. Кроме того, учёные выяснили, что у предка всех рукокрылых было 26 пар хромосом, а последующие линии чаще подвергались слиянию хромосом, чем разделению или обмену участками. Эти выводы меняют представления о ранних этапах диверсификации и геномной организации группы.

На следующем этапе учёные включили в анализ 44 ископаемых видов, существовавших до начала четвертичного периода (не позднее 2,58 миллиона лет назад), а также 21 современный вид — по одному от каждого семейства. Обобщение морфологических данных и генетических данных для ныне живущих видов позволило выделить раннюю кладу Eochiroptera, включавшую районы Archaeonycteridae, Onychonycteridae, Icaronycteridae, Hassianycteridae, Palaeochiropterygidae и Vielasia; она отделилась от эвоюционной линии рукокрылых ещё на раннем этапе и исчезла без потомков. Кроме того, выделена другая ранняя и полностью вымершая клада, включающая несколько родов, которые напоминали современных инь-рукокрылых и обладали способность к гортанной эхолокации; один из членов этой группы — Aegyptonycteris knightae — первым среди рукокрылых начал питаться растительной пищей вместе с животной. Результаты подчеркивают сложность ранних ветвей и раннюю диверсификацию в ответ на эволюционные адаптации.

Контекст и необычные детали исследования указывают на то, что европейский центр происхождения рукокрылых повлиял на дальнейшие миграции в Африку и далее в другие континенты, а дистанционные переходы через сушу и острова позволяли формироваться современным подотрядом и надсемействам. В частности, Noctilionoidea, по данным анализа, возникло в Европе и затем распространилось в Северную Америку и оттуда — в Южную Америку; родиной Europe считается и надсемейство Vespertilionoidea, тогда как Emballonuroidea — Африка. Эти выводы отражают сложную картину межконтинентальных переселений на фоне климата и географии эпохи палеоцена–эоцена.